这个问题是因为在数据库服务器中的mysql数据库中的user的表中没有权限(也可以说没有用户)，下面将记录我遇到问题的过程及解决的方法。
　　在搭建完LNMP环境后用Navicate连接出错
　　遇到这个问题首先到mysql所在的服务器上用连接进行处理
　　1、连接服务器: mysql -u root -p
　　2、看当前所有数据库：show databases;
　　3、进入mysql数据库：use mysql;
　　4、查看mysql数据库中所有的表：show tables;
　　5、查看user表中的数据：select Host, User,Password from user;
　　6、修改user表中的Host:update user set Host='%' where User='root';
　　7、最后刷新一下：flush privileges;

一定要记得在写sql的时候要在语句完成后加上" ; "下面是图示说明

　　遇到这个问题首先到mysql所在的服务器上用连接进行处理
　　连接服务器: mysql -u root -p

　　查看当前所有数据库：show databases;

　　进入mysql数据库：use mysql;

　　查看mysql数据库中所有的表：show tables;

　　查看user表中的数据：select Host, User,Password from user;

　　修改user表中的Host:update user set Host='%' where User='root';

　　最后刷新一下：flush privileges;

　　重新在Navicate中测试一下：

注意：安装MySQL5.7后，如果没有为root用户提供密码，它将使用auth_socket插件。该插件只检查用户是否使用UNIX套接字进行连接，然后比较用户名，不关心也不需要密码。
如果要配置密码，需要同时更改插件并设置密码，SQL语句如下所示：
方式一：

mysql> ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY 'PWD';
mysql> flush privileges;

方式二：

mysql> UPDATE mysql.user SET plugin='mysql_native_password', authentication_string=PASSWORD('PWD') WHERE user='root' AND host='localhost';
mysql> flush privileges;

第一种问题的解决办法是:

 //在iptables中开放3306端口
 #/sbin/iptables -I INPUT -p tcp --dport 3306 -j ACCEPT
 #/etc/rc.d/init.d/iptables save  保存：
 # service iptables restart  重启生效

#

iptables -I INPUT -p TCP -s 0.0.0.0/0 --dport 3306 -j ACCEPT    //我常用的在iptables中开放3306端口命令

第二种解决方法是:

 // 设置远程用户访问权限：
 // 任何远程主机都可以访问数据库
mysql> GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'root'@'%'WITH GRANT OPTION;     
//需要输入次命令使修改生效
mysql> FLUSH PRIVILEGES; 
//退出
mysql> EXIT    

(还有一种方法说是关闭服务器防火墙:# service iptables stop 不建议使用这种方法,会引发未知的安全问题)
很明显最后还是没有解决,在网上的资料很多都是重复的,最后实在没办法,找了师兄帮忙才发现是阿里云控制台这边的问题,说明自己思考的方向还是不对.具体的解决方法是:

打开云服务器ECS
打开左边菜单的实例
打开实例最右边的管理
打开左边菜单的本实例安全组
打开右边的配置规则
右上角添加安全组规则
协议类型默认自定义,端口范围:3306/3306,授权对象:0.0.0.0/0,其他默认就行
确定后重启服务器
连接OK!